Environmentally, it is argued that genes might end up in unexpected places and mutate with harmful effects (for example, creating “superweeds” that are resistant to pests and herbicides), that “sleeper” genes could be accidentally switched on while active genes could become “silent”, and that genes might interact with wild and native populations, with adverse effects on birds, insects and soils, while inadvertently harming beneficial predators of crop pests.
ومن الناحية البيئية، يقال إن الجينات قد ينتهي بها الأمر في أماكن غير متوقعة، وقد تتحول وتكون لها آثار ضارة (من ذلك مثلا أنها تؤدي إلى ظهور “أعشاب شديدة المناعة” تقاوم الآفات ومبيدات الأعشاب)، كذلك فإن الجينات “النائمة” يمكن أن تستيقظ صدفة وأن تصبح الجينات النشطة “هامدة”، ويمكن أن تتفاعل الجينات مع الكائنات البرية والمحلية بما قد يترتب على ذلك من آثار سلبية على الطيور والحشرات والأتربة، في حين يعود ذلك دون قصد بالضرر على الكائنات المفيدة التي تتغذى على آفات المحاصيل.