Bien qu'on ait signalé la disponibilité de substituts techniques pour la grande majorité des utilisations du bromure de méthyle, le Comité des choix techniques pour le bromure de méthyle indique que des difficultés persistent dans certains domaines d'utilisation, notamment dans les cas spécifiques des pépinières qui nécessitent une certification, par exemple le repiquage du ginseng et l'élimination des espèces Striga et Orobanche, dans certaines circonstances.